所得額之計算，若涉有應稅所得及免稅所得者，其相關之成本、費用或損失，除可直接合理明確歸屬應個別歸屬認列外，無法直接合理歸屬者，應予以合理分攤
財政部臺北國稅局表示，營利事業所得之計算，以其本年度收入總額減除各項成本費用、損失及稅捐後之純益額為所得額。所得額之計算，涉有應稅所得及免稅所得者，其相關之成本、費用或損失，除可直接合理明確歸屬者，得個別歸屬認列外，其餘無法直接歸屬者，應作合理之分攤。
該局查核轄內A公司100年度營利事業所得稅結算申報案件，發現該公司係以買賣有價證券為專業，其申報時將買賣國內有價證券及獲配之股利收入列入免稅所得，惟其免稅所得未依規定歸屬及分攤相關之營業費用及利息支出。故該局依「營利事業免稅所得相關成本費用損失分攤辦法」，將可直接歸屬營業費用及利息支出，予以個別歸屬認列後，再按免稅收入占全部營業收入及非營業收入之比例，計算應分攤營業費用300餘萬元，並將原列報當期利息支出200餘萬元予以遞延，共計補徵稅額85餘萬元。
該局再次呼籲，營利事業於計算營利事業所得稅時，應注意若同時有應稅所得及免稅所得時，其相關營業費用或利息支出是否已依規定，予以合理歸屬、分攤或遞延認列，以免遭剔除補稅。